История образования Боханского района насчитывает почти три столетия. Первое учебное заведение – двухклассное Идинское училище было открыто в 1816году и содержалось на средства населения. Организатор и учитель училища — Иван Иннокентьевич Пирожков. Этому человеку принадлежала огромная заслуга в открытии Боханской школы №1 в 1862 году. Иван Иннокентьевич проработал в школе до 1874 года, до конца своей жизни. Преданность и бескорыстное служение делу просвещения своего народа снискали ему глубокое уважение и признательность не только современников, но и потомков.
Первые школы, первые учителя, их заслуги несомненны, ни с чем несравнимы. Нет профессии более заслуживающей признательности, чем профессия учителя. Его заботы живут в благодарной памяти учеников. У истоков просвещения в XIX и начале XX вв. стояли К.Н.Богданов, М.Н.Хангалов, Я.А.Балданов, Н.С. Балданов, Ф.П. Петелин, С.П. Балдаев и др. Головная школа района – Боханская средняя общеобразовательная школа №1 – насчитывает 148 лет непрерывной образовательной деятельности. Отметили столетние юбилеи Александровская, Хохорская, Укырская, Верхне-Идинская, Каменская, Олонская, Дундайская средние школы.
В 1930 году на основе Боханской школы второй ступени было создано педагогическое училище, первым директором которого стал Н.А.Петропавловский. За 75 лет существования училище подготовило более девяти тысяч учителей начальных классов, физкультуры, трудового обучения, рисования, английского языка, воспитателей ГПД, воспитателей для дошкольных учреждений.
На базе педагогического училища в 2001 году открылся филиал Бурятского госуниверситета. Первым директором был А.В. Дамдинов.
Проблему трудовых кадров для сельского хозяйства и промышленности района решает Боханское профессиональное училище №57.
Муниципальная образовательная система района представлена 74 учреждениями всех типов: в дневных общеобразовательных школах обучается 3667 учащихся, из них численность обучающихся в первую смену 90,7%. Успеваемость учащихся в 2008 году составила 97,3%. В дошкольных учреждениях воспитывается 946 детей, охват детей дошкольного возраста составляет 36%.
В образовательную систему входят — 14 средних общеобразовательных школ, 2 основные общеобразовательные школы, 24 начальных общеобразовательных школ, 11 начальных общеобразовательных школ-детских садов, вечернюю сменную школу, 15 дошкольных образовательных учреждений, оздоровительный лагерь «Чайка», межшкольный производственный комбинат, детская юношеско-спортивная школа, Дом Детского Творчества.
Образовательные учреждения района активно решают задачу обновления содержания образования, расширяя спектр образовательных услуг и программ для различной категории учащихся. В районе реализуются направления Национального проекта «Образование».
В январе 2009 года введено в эксплуатацию здание Хохорской средней школы. Продолжается строительство Каменской средней школы. Проводится работа по открытию дополнительных групп в детских дошкольных учреждениях в муниципальных образованиях «Середкино», «Тихоновка», «Тараса», «Бохан».
Районный центр п. Бохан — студенческий. На базе ОГОУ СПО «Боханский педагогический колледж им. Д.Банзарова» обучаются 314 студентов.
На базе ГОУ Боханское ПУ-57 обучают 354 студента по специальностям тракторист-машинист, водитель, повар, продавец, мастер лесного хозяйства.
В филиале Бурятского государственного университета по 8 специальностям обучается 234 студента.
Потребность современного образования настоятельно требует взаимодействия школы и науки в системной организации научного поиска по приоритетным направлениям, постановке и решению новых задач, новых тем. В режиме эксперимента работают три педагогических коллектива: на федеральном уровне — МОУ «Олонская СОШ» (директор Ступин И.Ф.) по теме «Школа-комплекс социокультурного развития, эколого-гигиенического образования, оздоровления детей и взрослых на селе». На муниципальном уровне — МОУ «Боханская СОШ №1» (директор Петрова Е.П.) по теме «Организация личностно-ориентированного учебного процесса через профильную, предпрофильную подготовку учащихся», МОУ «Буретская СОШ (директор Ткач А.С.) по теме «Социализация личности школьника на основе индивидуального подхода в условиях сельской местности». Инновационная деятельность этих школ была отмечена Министерством образования и науки РФ премией в один миллион рублей. Учащиеся общеобразовательных учреждений района успешно выступают на областных, Всероссийских конкурсах, конференциях, олимпиадах, соревнованиях. Ребята активно включены во Всероссийскую научно-социальную программу «Шаг в будущее».
В сфере образования трудятся 669 педагогических работников. Звания «Заслуженный учитель школы РФ» удостоены 8 человек. Отличников просвещения и Почётных работников общего образования — 75 педагогов, Почётной грамотой Министерства и науки РФ награждены 30 учителей. В рамках Приоритетного национального проекта «Образование» победителями конкурса «Лучшие учителя РФ» являются 13 педагогов района. Почётной грамотой Министерства образования Иркутской области награждены 20 учителей района.